Las obras estuvieron a cargo del arquitecto Fernando Pérez Oyarzún, quien lidera un Plan Maestro de conservación del museo. En el marco de esta iniciativa, también está prevista la conservación del anfiteatro del sector norte.
Según señala una carta de la Asociación Nacional de Trabajadores del Patrimonio, Anatrap, los problemas van desde dificultades en la descentralización de la entidad hasta incertidumbre por la renovación de trabajadores a honorarios.
